Для получения информации о расхождениях кроме интерфейса сверки используйте выгрузку Протокола расхождений.
Для этого нажмите кнопку Сформировать протокол расхождения:

Протокол расхождений можно выгрузить в 2 вариантах печатных форм. Выберите вариант в зависимости от задачи.
«Только протокол» - будет полезно выгрузить, чтобы поработать с расхождениями и отправить контрагенту для предварительного ознакомления.

«Протокол и печатная форма» - включает итоговый акт сверки, заполненный данными из двух загруженных файлов, и протокол расхождений. Этот документ можно распечатать подписать и отправить по электронной почте или отправить через ЭДО для итогового подписания с контрагентом.

Как читать протокол расхождений:
1. Отсутствует операция с одной из сторон
Когда в описании проставлено это значение, красным подсвечены поля, где отсутствуют документы .
Эта ситуация может иметь место , если у вас или контрагента не проведены внесенные операции или не хватает документов . В примере ниже, видно документ который можно отправить контрагенту и запросить на его основании недостающие документы.

2. Расхождения в датах операции
В случае если есть особенности учета, поступления или оплаты могут вноситься позже даты, которая стоит в документе. В таком случае , даты операций программа подсветит как расхождение, и оно попадет в Протокол.
Если для Вас это не является расхождением, выберите на интерфейсе нужную строку, и в контекстном меню укажите что это не расхождение и примените ко всем подобным операциям, в таком случае они не попадут в протокол.

3. Расхождения в сумме операций
В случае если расхождение в суммах у Вас и контрагента всего в 1 копейку, сервис обнаружит и подсветит ее. Возможно это особенности 1с вашей или контрагента, но может быть расхождения связаны с неправильным внесением первички в учетную систему, или разница в отгруженных и полученных товарах/услугах/оплатах.
В графе «сумма» программа покажет , на какую сумму идет разница. Сервис математически пересчитывает разницу сумм по одной операции , учитывая +/- по суммам операций.

4. Расхождения в договорах, номерах и датах документа
Расхождения в договорах, номерах и датах документа будут отражены в отдельной вкладке, в описании сервис укажет какие нашел расхождения: в номере договора или в дате договор, или не сошлись Дата и номер документа. Вам остается либо поправить свои данные либо отправить протокол контрагенту.

ВНИМАНИЕ!!! Скрытые операции на интерфейсе сверки
Если на интерфейсе Вы воспользовались опциями «Не считать расхождением» или «Скрыть операцию»– в протоколе это будет отражено по-разному.
Если сделали «Не считать расхождением» программа не отобразит операции в протоколе, при этом суммы операций будут учтены в общем обороте по дебету и кредиту.
Если использовали «Скрыть операции» программа не только не отобразит эти операции в протоколе, но и вычтет эти операции из общей суммы оборота.